这说明薛瑄对自然界全体、部分和特殊的关系有了进一步认识，作了比较深刻的论述。
[44] 其实，这个虚寂本体，不是别的，就是气之灵或灵气，通天地万物一气耳，良知气之灵也，生天生地生万物，而灵气无乎不贯，是谓生生之易。太极与阴阳虽是理气关系，但那是更高层次上的关系，即宇宙模式及其物质实体的关系，太极是决定阴阳的。
于是有人提出，朱熹篡改了原文并《太极图》。就宇宙论而言，太极指阴阳未分之气，是宇宙本源。支离颠倒，岂其然耶？[66] 说明他坚持以太极为气的立场是很坚定的，也是针对朱熹而言的。[8]一物两体是张载的重要思想，以后还要讨论。不过，朱熹是就客观自然界而论，王阳明则是从主客体关系而言。
这个任务是由王夫之完成的。[74] 按照他的解释，有阴阳动静方有太极之体，不是先有太极之气而后生出阴阳，太极只能是阴阳的统一体。因为周敦颐在《太极图说》中不仅提出了生成论哲学，而且提出了本体论哲学，无极而太极便是表示其本体论思想的重要命题。
王阳明提出以良知为世界本体，强调其主观性，正是提倡主体性原则。在这个体系中，最高范畴就是太极，因为它是先天学的出发点。太极……有离乎阴阳也，即阴阳而指其本体，不杂乎阴阳而为言也。邵雍认为，宇宙是一个无穷的大循环，太极分出阴阳，阴阳阖辟，产生天地万物，经过生、长、兴、衰到灭。
经历一个很长的但是有固定时间的过程，世界消尽之后，又重新开始，从卦象上看，复、垢两卦之间，正是阴阳相接之处，起点就是终点。生阳生阴而生水火土金木而生万物，皆一气自然之变化，而合之只是一个生意，此造化之缊也。
只有一阴一阳之道，才是存在于太极之前的形而上者。太极是众理的全体，万理的总名，总天地万物之理，便是太极[13]。[37]《放心说》，《吴草庐集》卷四。王阳明把心提升为宇宙本体，代替了太极，他又是如何解决太极和阴阳的关系呢？他认为，对于周敦颐的太极生阴阳的说法苟不善观，亦未免有病。
若论其生则俱生，太极依旧在阴阳里。一阴一阳之谓道，即太极也。关于生物和人类的演化，则又用气化和形化两个范畴加以说明。[62] 以太极为元气，这本是两汉儒家的思想，所谓太极未判，函三为一之类，即是此意。
夫良知一也，以其妙用而言谓之神，以其流行而言谓之气，以其凝聚而言谓之精，安可以形象方所求哉？真阴之精即真阳之气之母，真阳之气即真阴之精之父，阴根阳，阳根阴，亦非有二也。但是对周敦颐的无极而太极这句话，从南宋以来直到今天，还有争论。
两仪，太极中所具足之阴阳也，为气质为精神，则其体有异。是岂动静无端，阴阳无始之谓乎？[57]动静无端，阴阳无始，这是宇宙生成、发展的真正根源。
阴阳播而为五行，五行即阴阳也。周敦颐的宇宙论，是有以无为本，不是有生于无。罗钦顺虽然确立了气本体论，但没有提出以太极为气的思想。这套体系是逻辑地先天存在的，圣人画卦之前，此卦已存。[63]不可知其所至，故曰太极。宇宙的本体是什么，这确是一个形而上学的问题，理学家朱熹提出以太极之理（大全）为世界本体，强调其客观性，但同样不能离开主体观念，因为对世界的任何表述，都需要一定的思维形式或结构，因此，离开主体，世界及其本原的问题就毫无意义。
这在一定程度上克服了朱熹在太极阴阳范畴上的矛盾，同时又由于维护理本体论而表现出更大的矛盾。这样的无限，并不是绝对的空无，不是恶的无限，其实它就在有限中。
他指出，宋以来的儒者，纷纷言太极，言两仪，以太极为万物本体，实际上失了太极两仪之本旨。有浑浑者，有生生者，皆道之体也。
陈淳提出心为太极，在于提倡心的主体作用，从而达到心理合一。但流传至今的《太极图说》，经过朱熹之手，其首句是无极而太极。
阴阳则是太极所生的两种对立的物质，太极和阴阳还没有变成理和气的关系。太极……，求其实，即天地未判之前，大始浑沌清虚之气是也。[38] 良知作为绝对本体，具有太极所具有的一切性质和作用，冲漠无朕之为本体，又是原无内外的，正因为如此，它才能成为万物本体，我的良知就是天地万物的太极。精神与物质妙合而形成万物，这一思维方式，为后来的理气论奠定了理论基础。
太极生生之理，妙用无息而常体不易。二程不讲太极而代之以理，他们从根本上抛弃了象数学，也批判了以无和气为本的学说，理变成了最高本体，周敦颐的太极和张载的太虚一起被彻底否定了。
这种说法，有一个很大的问题，就是太极由宇宙总规律变成实体性范畴之后，阴阳则成了太极的作用及其结果。[69] 阴阳二者既是构成万物的两种实体，而其才质、性情与功效又皆相反，但又不可相无。
它是有、无的统一，而以有为其基本特征或存在形式。这就从体、用和数的关系说明阴阳二者的对立，并体现在一切事物中。
程颐说：有理而后有象，有象而后有数。[32]《奏议》，《鹤山大全文集》卷十五。有人说，陈献章完全继承了陆九渊思想，但陆并不讲无极，陈却以无极为心之本体，这显然是有区别的。对此，我们只能根据《图说》全文并参考《通书》的内容，进行分析。
因为后者强调原始统一，主要是讲生成问题，即先有太极而后有阴阳。浑然者充塞宇宙，无迹无执，不见其始，安知其终。
易因象以明理，由象而知数。而王阳明以后，普遍出现了太极即气的学说。
[18] 就生成论而言，生则俱生，不能说太极生阴阳，这是显而易见的。但是从形而上的观点看，必须说阴阳在太极里。
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